Es gibt eine Vielzahl von Krankheitserregern, die akute Atemwegserkrankungen auslösen können. Meistens sind Viren die Ursache.
Bei Erwachsenen sind Rhinoviren, von denen über 100 verschiedene Serotypen bekannt sind, die häufigste Ursache von Erkältungen. Weitere Erkältungsviren sind Coronaviren (nicht gemeint ist SARS-CoV-2). Bei Kindern sind auch Parainfluenzaviren, das Respiratorische Synzytial-Virus (RSV), Adenoviren und gewisse Enteroviren häufige Ursachen von akuten Atemwegsinfektionen.
Weitere Erkrankungen mit Atemwegssymptomen sind die Grippe, verursacht durch Influenzaviren, Covid-19, verursacht durch SARS-CoV-2, und Keuchhusten (Pertussis), verursacht durch das Bakterium Bordetella pertussis. Lungenentzündungen können auch durch Pneumokokken (Bakterium Streptococcus pneumoniae) oder Legionellen (Bakterien der Gattung Legionella) ausgelöst werden.
Auch durch andere Viren oder Bakterien ausgelöste Krankheiten können mit Atemwegssymptomen einhergehen.